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您的位置:首页 > 综合教程 》 生物信息学全攻略:从测序到数据分析实战
  • 教程简介
    本课程专为生物信息学初学者设计,涵盖从基础到高级的全套技能培训。课程内容包括Linux操作、生物软件与数据库管理、多种测序技术原理及数据处理、新冠病毒数据分析、基因组拼接与评估、RNAseq与单细胞测序分析等。通过源码实战,学员将掌握从数据获取到分析结果的全流程技能,适用于希望快速提升生物信息学实战能力的科研人员及学生。课程内容全面,结合最新技术趋势,助您成为生物信息学领域的专家。
    以下云资源目录树快照生成于[12个月前],该学习资料由夸克云用户[心旷*怡的青蛙]分享(只展示大部分文件和目录)
    生物信息学全攻略:从测序到数据分析实战74.09GB(mp4视频252节;7z压缩包1个;)
    课件.7z408.4MB
    60三代纳米孔变异检测
    259纳米孔测序SNP与SV检测.mp4368.46MB
    258纳米孔数据比对.mp493.72MB
    257纳米孔测序变异检测原理.mp488.53MB
    59二代测序变异检测
    256snp注释.mp4508.61MB
    255vcf文件.mp4657.06MB
    254外显子与panel数据分析.mp4244.86MB
    253gatk变异检测.mp4419.13MB
    252bam文件处理.mp4512.93MB
    251生成bam.mp4422.62MB
    250变异检测原理.mp490.91MB
    249gatk简介.mp4144.75MB
    51三代纳米孔宏基因组拼接
    214三代纳米孔宏基因组拼接.mp4227.01MB
    217纳米孔组装纠错.mp4287.53MB
    216nanopore宏基因组真实数据拼接.mp4285.34MB
    215nanopore模拟数据拼接.mp4509.61MB
    50二代宏基因组拼接
    213二代宏基因组真实数据拼接.mp4424.65MB
    212二代宏基因组模拟数据拼接.mp4282.89MB
    48二代宏基因组测序数据分析
    206二代宏基因组分析数据库下载.mp4535.19MB
    205二代宏基因组分析软件安装.mp4251.7MB
    209humann功能分析.mp4145.65MB
    208metaphlan物种分类.mp4298.17MB
    207kneaddata质控.mp4244.2MB
    46三代nanopore测序宏基因组数据分析
    200三代测序宏基因组物种分类鉴定.mp4391.57MB
    202物种分类练习.mp4232.66MB
    201pavian结果可视化.mp4227.17MB
    199centrifuge数据库.mp4156.53MB
    198centrifuge安装.mp4218.87MB
    197物种分类原理.mp4127.04MB
    13三代测序基因组拼接
    55不同物种拼接练习.mp4290.75MB
    54细菌完成图.mp4434.14MB
    53组装结果纠错.mp4421.62MB
    52pacbio及nanopore基因组拼接.mp4651.18MB
    10二代基因组拼接
    45二代测序拼接实战.mp4236.82MB
    44二代测序拼接算法.mp468.38MB
    43kmer估计基因组大小.mp4270.6MB
    42基因组拼接原理.mp477.06MB
    41了解基因组拼接.mp4157.64MB
    61igv变异可视化
    260igv变异可视化.mp4178.96MB
    58人基因组数据分析环境搭建
    248瓶中基因组.mp4130.94MB
    247人基因组分析环境搭建.mp4416.01MB
    57人基因变异检测
    246拼接与reads比对方法比较.mp4160.55MB
    245参考序列的影响.mp486.87MB
    244全基因组与外显子和panel测序.mp4116.58MB
    243人基因组分析简介.mp4204.58MB
    56利用R分析16S数据
    242.16S功能分析.mp4145.82MB
    241利用phyloseq可视化结果.mp4198.24MB
    240dada2练习案例.mp4204.37MB
    239dada2物种分类鉴定.mp4269.36MB
    238利用dada2处理16S数据.mp4471.17MB
    237拆分barcode.mp4145.84MB
    55利用qime2分析16S数据
    236不同组间丰度差异比较.mp4218.83MB
    235物种分类鉴定及可视化.mp4223.45MB
    234多样性分析.mp4359.43MB
    233qiime2实战.mp4432.3MB
    232qiime2导入数据.mp4472.82MB
    231qiime2简介.mp4224.19MB
    54扩增子分析简介
    230探索16S序列.mp4159.31MB
    229metadata.mp456.07MB
    228.16S分析环境搭建.mp4376.98MB
    227alpha和beta多样性.mp4208.72MB
    226OTU还是ASV?.mp4129.86MB
    225扩增子测序简介.mp4314.66MB
    53metawrap分箱
    224metawrap案例.mp4260.93MB
    223metawrap配置.mp4304.89MB
    222metawrap分箱.mp4182.9MB
    52宏基因组功能分析
    221宏基因组定量分析.mp4247.76MB
    220宏基因组基因功能注释.mp4203.61MB
    219cdhit去冗余.mp4215.29MB
    218宏基因组基因预测.mp4285.85MB
    49宏基因组分析结果可视化
    211stamp分组比较.mp4241.72MB
    210megan物种分类结果可视化.mp4321.17MB
    47临床病原微生物检测
    204批量进行致病菌鉴定.mp4237.44MB
    203临床样本病原微生物检测.mp4241.81MB
    45宏基因组分析环境搭建
    196国内镜像下载宏基因组数据库.mp4148.87MB
    195宏基因组分析环境搭建.mp4216.17MB
    44宏基因组简介
    194宏基因组建库测序.mp4140.63MB
    193宏基因组简介.mp4388.23MB
    43空间转录组
    192空间转录组.mp4117.4MB
    40利用Seurat分析单细胞数据
    183Seurat练习.mp4388.98MB
    182寻找marker基因以及细胞鉴定.mp4442.69MB
    181细胞亚群分类.mp4326.46MB
    180聚类.mp4241.5MB
    179质控过滤以及标准化.mp4184.39MB
    178Seurat读取数据.mp4137.62MB
    177安装Seurat.mp4285.38MB
    39单细胞测序数据分析
    176_10x练习数据.mp4140MB
    175LoupeBrowser.mp497.35MB
    174结果解读.mp4195.2MB
    173利用cellranger分析单细胞数据.mp4370.85MB
    172单细胞分析环境搭建.mp4307.2MB
    38单细胞测序概述
    171_10xgenomics资源以及常见问题.mp4185.68MB
    170单细胞测序原理.mp4291.58MB
    169单细胞测序概述.mp4295.76MB
    37差异表达基因注释以及富集分析
    168GSEA分析.mp4584.03MB
    167非模式生物注释富集.mp4195.19MB
    166注释富集练习.mp4151.1MB
    165富集分析.mp4386.1MB
    164差异表达基因功能注释.mp4336.19MB
    36利用R分析RNAseq数据
    163edgeR练习.mp4272.1MB
    162edgeR分析RNAseq数据.mp4391.21MB
    161DESeq2练习.mp4117.1MB
    160DESeq2分析RNAseq数据.mp4411.71MB
    35RNAseq分析
    159HTSeq-count计数.mp4159.83MB
    158STAR比对.mp4163.17MB
    157featureCounts计数.mp4131.42MB
    156hisat2比对.mp4240.31MB
    155hisat2建立索引.mp4142.87MB
    154数据质控过滤.mp4425.05MB
    153下载练习数据.mp4326.77MB
    152下载参考序列.mp4492.71MB
    151Bioconductor.mp4245.71MB
    150RNAseq分析环境搭建.mp465.88MB
    34RNAseq概述
    149RNAseq定量方法.mp4278.43MB
    148RNAseq不同测序平台比较.mp4159.27MB
    147RNAseq建库方法.mp4182.15MB
    146RNAseq原理.mp4208.44MB
    145RNAseq简介.mp4208.82MB
    33基因表达调控简介
    144关于基因的概念.mp475.72MB
    143GEO数据库简介.mp4231.89MB
    142基因表达调控.mp4191.25MB
    32ggplot2绘图
    141科学文献绘图.mp4535.59MB
    140ggplot2扩展.mp4507.47MB
    139ggplot2小提琴图以及主题设置.mp4245.77MB
    138ggplot2分组条形图以及箱线图.mp4512.19MB
    137ggplot2散点图直方图条形图.mp4363.93MB
    136ggplot2绘图.mp4153.84MB
    31R基础绘图
    135绘图布局.mp4181.97MB
    134韦恩图.mp4225.6MB
    133箱线图以及小提琴图.mp4145.77MB
    132条形图以及分组条形图.mp4231.87MB
    131饼图以及扇形图.mp4101MB
    130直方图.mp4490.47MB
    129R基础绘图.mp4246.87MB
    128R语言技巧.mp4140.61MB
    30R统计建模
    127机器学习预测乳腺癌.mp4290.96MB
    126购物篮分析.mp4270.01MB
    125统计建模.mp4291.77MB
    29R统计检验
    124相关性检验.mp498.41MB
    123独立性t检验.mp4461.95MB
    122独立性卡方检验.mp4219.38MB
    28R数据处理
    121dplyr数据处理.mp4383.6MB
    120tidyverse.mp4300.81MB
    119分组计算以及数据透视表.mp4298.2MB
    118随机抽样以及数据探索.mp4380.76MB
    117数据转换.mp4447.32MB
    116数据处理.mp4267.12MB
    27R数据结构
    115因子列表缺失数据.mp4270.18MB
    114数据框.mp4422.41MB
    113矩阵.mp4126.21MB
    112向量索引.mp4294.3MB
    111向量.mp4150.78MB
    26R语言基础入门
    110文件操作.mp4295.31MB
    109R包管理.mp4398.24MB
    108R环境设置.mp4186.37MB
    107开始使用R.mp4311.41MB
    106rstudio设置.mp4238.76MB
    105R语言以及Rstudio安装.mp4128.98MB
    104R语言简介.mp498.54MB
    25ubuntu系统配置
    103虚拟机安装ubuntu.mp456.58MB
    102ubuntu系统配置.mp4156.22MB
    24生物信息分析平台搭建
    101安装网络应用.mp478.08MB
    100配置R语言分析环境.mp4195.1MB
    99配置生物数据库.mp486.35MB
    98配置生物软件.mp4239.72MB
    97用户管理.mp4303.28MB
    96重置服务器练习.mp4184.24MB
    95升级centos-stream.mp496.32MB
    94基础环境配置.mp4296.75MB
    23生物信息分析服务器简介
    93磁盘操作.mp4107.84MB
    92yum工具.mp4222.74MB
    91设置云服务器.mp4114.58MB
    90选择RAID.mp4122.04MB
    89安装操作系统.mp4139.6MB
    88硬件选购.mp4168.06MB
    87服务器简介.mp4109.41MB
    22shell编程
    86shell判断.mp454.58MB
    85shell循环.mp4183.02MB
    84shell变量.mp4133.08MB
    21表格处理
    83datamash.mp4142.32MB
    82csvtk.mp499.86MB
    81bioawk.mp452.84MB
    80表格处理awk.mp4241.65MB
    79cut-sort-uniq.mp4194.6MB
    20Linux高级操作
    78文本编辑.mp4297.28MB
    77文本筛选grep.mp4392.63MB
    76文件搜索.mp4408.35MB
    75正则表达式.mp4139.2MB
    74生物信息常用文件格式.mp4166.94MB
    19sam和bam文件处理
    73sam和bam处理案例(下).mp4195.84MB
    72sam和bam处理案例(上).mp4293.57MB
    71sam和bam格式文件介绍.mp4135.68MB
    18测序数据比对
    70多重比对问题如何处理.mp468.82MB
    69长读长序列比对.mp4204.44MB
    68段序列比对练习.mp4207.85MB
    67测序数据比对.mp4291.02MB
    17基因家族分析
    66基因家族分析.mp4608.01MB
    16共线性分析
    65MCScanX共线性分析.mp4216.61MB
    64共线性分析.mp4310.01MB
    15序列比对
    63全局比对.mp4333.78MB
    62blast使用案例.mp4693.37MB
    61blast比对.mp4216.82MB
    14基因组序列分析
    60重复序列分析.mp4197.72MB
    59ncRNA分析.mp4229.23MB
    58基因功能注释.mp4274.25MB
    57真核生物基因预测.mp4251.43MB
    56原核生物基因预测.mp4491.14MB
    12基因组拼接探索
    51混合拼接.mp4436.16MB
    50基因组拼接探索.mp4287.1MB
    11拼接结果统计及评估
    49tablet以及bandage评估.mp4476.56MB
    48busco评估.mp4104.55MB
    47quast评估.mp4173.69MB
    46fasta格式文件介绍与处理.mp4206.09MB
    09构建系统发育树
    40变种病毒识别.mp470.12MB
    39iTol美化系统发育树.mp4251.57MB
    38构建系统发育树.mp4395.85MB
    08新冠病毒数据分析
    37ArticNetWork流程.mp4410.93MB
    36拼接新冠病毒基因组.mp4109.92MB
    35新冠病毒拼接结果验证.mp4422.28MB
    34新冠参考基因组拼接.mp4350.68MB
    33新冠病毒快速鉴定.mp4396.77MB
    32下载新冠分析数据库.mp4778.19MB
    31下载新冠病毒基因组序列.mp4353.68MB
    30新冠病毒测序.mp4428.35MB
    07解决软件报错
    29解决软件报错.mp4696.19MB
    06nanopore测序原理及数据处理
    28nanopore数据处理.mp4382.28MB
    27碱基识别.mp4310.32MB
    26nanopore测序原理.mp4554.31MB
    05pacbio测序原理及数据处理
    25pacbio数据处理.mp4235.48MB
    24pacbio测序原理.mp4367.5MB
    04illumina测序原理及数据处理
    23数据质控和过滤.mp41GB
    22fastq文件处理.mp4753.34MB
    21fastq文件介绍.mp495.49MB
    20illumina测序原理之测序.mp4464.22MB
    19illumina测序原理之建库.mp4258.61MB
    18了解测序这件事.mp4405.66MB
    17测序数据下载.mp4667.07MB
    03生物软件及数据库
    16生物数据库管理.mp4441.69MB
    15虚拟环境.mp4524.03MB
    14腾讯云安装软件.mp4590.04MB
    13bioconda.mp4256.25MB
    12环境配置.mp4184.81MB
    11源代码编译.mp41.24GB
    10安装已编译软件.mp4679.01MB
    09生物软件简介.mp4332.99MB
    02Linux基础
    08权限和任务管理.mp4889.02MB
    07编辑脚本.mp41.13GB
    06文件操作2.mp41.31GB
    05文件操作1.mp4811.74MB
    04目录结构.mp41.06GB
    03Linux基础.mp4682.51MB
    02Linux介绍.mp4568.72MB
    01生物信息入门
    01生物信息入门.mp4325.89MB
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